函授专科培养具有某种专业知识和技能的中、高级人才，掌握一定的理论知识，具有某一专门技能，而函授本科要求学生具备合理的知识结构，掌握科学工作的一般方法，具有从事科学研究工作或负担专门技术工作初步工作能力的高级人才。
职业领域不同：函授本科教育知识的讲授不仅是要有函授大专的纵深发展，还要注意学科间的横向关系，与此同时，函授本科教育培养学生的科学思维思维能力。
学科专业的不同：函授专科以面向行业或本地区为主，专业覆盖面较窄，数量较少，社会适应性有限。继续学习的潜能较弱。函授本科以面向行业，面向大经济区域为主，专业覆盖面较宽，数量较多，社会综合适应性较强。继续学习的潜能较大。
文凭不同：函授本科有学士学位，而专科没有学位，这意味着函授本科毕业生可以申请学位证书，而函授专科毕业生不可以，两者之间的受教育程度和学术水平有一定的差别。
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